 |
В составе большого научного коллектива ученые АлтГУ расшифровали трехмерную структуру химозина алтайского марала
Ученые Алтайского государственного университета совместно с коллегами из Новосибирска, Кольцово, Уфы и Москвы расшифровали трехмерную структуру рекомбинантного химозина алтайского марала.
Рекомбинантный химозин марала — это фермент, полностью аналогичный тем, что выделяется слизистой оболочкой желудка оленят в период молочного вскармливания. Он способен заменить импортные препараты рекомбинантных молокосвертывающих ферментов, широко используемых в сыроделии.
От АлтГУ в проекте участвовали ученые ИЦ «Промбиотех», Российско-американского противоракового центра, института биологии и биотехнологии. Совместно с физиками, математиками, биоинформатиками, биологами, биотехнологами из других научных организаций им удалось пополнить банк PDB (Protein Data Bank), они депонировали пространственную структуру рекомбинантного химозина алтайского марала в PDB (Protein Data Bank) — это международный банк данных трехмерных структур белков. К 2023 году в PDB было представлено только две структуры химозинов — коровы и верблюда. Наши ученые оказались третьими.
«В мире существует два крупных научных хранилища, где хранятся данные о нуклеотидных последовательностях — это GenBank, для белков это PDB. Если в GenBank есть миллионы записей о разных генах, геномах и пр., то в PDB информации намного меньше, потому что расшифровать структуру белка — это на два порядка более сложная задача. На первом этапе мы должны узнать аминокислотную последовательность белка, потом этот белок получить, очистить, выделить так, чтобы получить препаративное количество этого белка, чтобы получить кристалл и потом уже понять его трехмерную структуру», рассказал ведущий научный сотрудник РАПЦ, кандидат биологических наук, доцент Дмитрий Щербаков.
Ученые Алтайского госуниверситета занимаются рекомбинантными ферментами уже несколько лет.
«С самого начал этой работы мы предполагали, что рано или поздно получим трехмерную структуру для химозинов тех млекопитающих, которые мы исследуем. Первым в этом ряду оказался химозин алтайского марала. Нам удалось не просто получить этот белок в нужных количествах, чтобы сделать выработку сыра. Мы смогли получить чистый белок и вырастить кристалл. Эта работа проводилась совместно с физиками из новосибирского академгородка. На основе кристалла удалось получить дифракционную картину — это когда на кристалл воздействуют определенным излучением и смотрят, как эти лучи рассеиваются при прохождении кристалла. Полученную дифракционную картину нужно было расшифровать — эту работу выполняли также коллеги из академгородка и Московского физико-технического института. Фактически из цифр (данных о рассеивании) и удалось воспроизвести трехмерную структуру», — отметил Дмитрий Щербаков.
С помощью трехмерной модели ученые рассчитывают приблизиться к пониманию тонких механизмов работы фермента. Например, узнать, почему он более термостабилен, чем его аналог. Зная трехмерную структуру, можно предполагать, как изменить фермент, чтобы улучшить его свойства.
«Это была комплексная работа, от Алтайского госуниверситета в проекте участвовала большая команды — это ученые из „Промбиотеха“, преподаватель кафедры экологии, биохимии и биотехнологии ИББ Дина Владимировна Балабова. Важна роль идейного вдохновителя исследования трехмерной структуры феремнтов, зав.кафедрой физико-химической биологии и биотехнологии, академик РАН, доктор химических наук, профессор Ольга Иванонва Лаврик. Полученный нами результат не является конечным. Мы будем получать и другие химозины — на очереди химозин тупаи, архара, косули и др. И, конечно, будем стремиться получить их трехмерные структуры», — подытожил Дмитрий Щербаков.
Контактное лицо: Spirina Ekaterina
Компания: Алтайский государственный университет
Добавлен: 20:57, 20.03.2023
Количество просмотров: 315
Страна: Россия
| В Алтайском ГАУ обсудили опыт практического применения землепользования, ФГБОУ ВО "Алтайский государственный аграрный университет", 01:14, 04.05.2024, Россия87 |
| 26 апреля в Алтайском государственном аграрном университете прошла IV Всероссийская (национальная) заочная научно-практическая конференция «Кадастр недвижимости, геодезия, организация землепользования: Опыт практического применения» |
| В Алтайском ГАУ обсудили вопросы агрострахования, ФГБОУ ВО "Алтайский государственный аграрный университет", 00:43, 04.05.2024, Россия81 |
| 25 апреля в Алтайском государственном аграрном университете состоялась Национальная научно-практическая конференция «Агрострахование, как механизм компенсации ущерба сельхозтоваропроизводителей» |
| В Алтайском ГАУ открыли новое коворкинг-пространство, ФГБОУ ВО "Алтайский государственный аграрный университет", 00:40, 04.05.2024, Россия72 |
| Сегодня, 25 апреля, в Алтайском государственном аграрном университете состоялся научно-консультационный семинар «Правило 4К. Кормозаготовка. Кормление. Комфорт. Кадры», организованный совместно с компанией «SPICA». Семинар прошел в новом коворкинг-пространстве, созданном компанией для студентов университета |
| Новая защита для промышленных и медицинских изделий, Тольяттинский государственный университет, 04:07, 26.04.2024, Россия102 |
| Учёные Тольяттинского государственного университета (ТГУ) вывели на качественно новый уровень технологию плазменно-электролитической обработки. Это позволит управлять её производительностью и свойствами керамических слоёв, формируемых на поверхности изделий, применяемых в энергетическом и химическом машиностроении, медицине и других областях промышленности, а главное, надёжно прогнозировать ожидаемые эффекты от варьирования параметров обработки. |
| Названы последствия пандемии для энергетической сферы, Тольяттинский государственный университет, 04:06, 26.04.2024, Россия100 |
| Пандемия COVID-19 вызвала значительные изменения в энергетическом секторе по всему миру. Исследование, проведённое специалистами Тольяттинского государственного университета (ТГУ) выявило усиление роли частных лиц в производстве и распределении энергии, при этом потреблять энергию люди стали более осознанно. |
|
|
